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1.排尿状态检查
应注意排尿姿势、排尿次数及排尿量的检查。
排尿时呻吟、不安、摇尾或后肢踢腹，称为排尿带痛，多见于膀胱炎、尿道炎等。病马未取正常排尿姿势，而不自主地排出少量尿液,称为尿失禁，见于腰荐部脊髓损伤和膀胱括约肌麻痹等。
排尿次数增多，而每次排尿量不减少的，称为多尿，见于大量饮水后、慢性肾炎及渗出性胸膜炎吸收期等；排尿次数增多，而每次排尿量减少的，称为尿频，见于膀胱炎、尿道炎等；排尿次数减少，而总排尿量也减少的，称为少尿或无尿，见于急性肾炎、剧烈腹泻及尿道阻塞等。
2.膀胱检查
主要是直肠内触诊。检查时，应注意膀胱内尿液的多少、有无异物、膀胱壁的厚度及敏感性等。膀胱空虚时，可感到如拳头大的梨状物；膀胱充满时，触压有波动感；膀胱炎时，触压有疼痛反应，并可感到膀胱壁增厚；膀胱结石时，常可触到硬如石块的物体；当膀胱充满，手压有尿液排出，停止压迫则排尿停止，称为尿潴留，见于膀胱平滑肌麻痹。
3.尿道检查
公马的尿道，主要由外部触诊，必要时用导尿管进行探诊。公马易发尿道结石。
母马的尿道，可用手指直接检查，也可用阴道开张器打开阴道进行尿道口视诊，或用导尿管探诊。母马易发尿道炎。
4.外生殖器官检查
对公马应注意阴囊、睾丸及阴茎的检查。多用视诊和触诊法。阴囊肿胀、睾丸肿大、有热有痛，见于睾丸炎等。阴茎脱垂，见于阴茎麻痹。此外，还要注意阴茎及包皮的外伤及肿瘤等。
对母马应注意阴道及乳房的检查。常用视诊、触诊和嗅诊法。阴道流出多量分泌物，见于阴道炎和子宫炎。阴道分泌物发恶臭味，见于子宫蓄脓等。阴道黏膜潮红、肿胀，见于阴道炎。乳房潮红、肿胀、硬固、温热、疼痛等，见于乳房炎。正常乳汁为均匀一致的白色液体。乳房有炎症时，乳汁减少，颜色异常，混有凝块。
5.肾脏检查
成年马可行外部触诊和直肠内触诊，马驹由外部触诊。
外部触诊时，可用双手在腰肾区部施加轻重不同的捏压，或将左手放在肾区部，右手握拳向左手背上捶击。急性肾炎时，病马表现为疼痛不安，背腰拱起，躲避检查。直肠内触诊，可以判定肾脏的大小、形状、位置、硬度及敏感性等。肾炎时，肾有压痛和肿大。