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1.神经状态检查
健康马精神敏锐，反应灵活。息病时，常出现精神兴奋或抑制状态。
(1)精神兴奋：是大脑皮质兴奋性增高的表现。此时病马容易惊恐，嘶叫不安，或狂奔乱跳等，常见于脑炎、狂犬病及某些中毒病等。
(2)精神抑制：是大脑皮质抑制过程占优势的表现，分为沉郁、昏睡和昏迷3种。
精神沉郁时，病马低头耷耳，眼半闭，站立不动，反应迟钝。许多疾病都会见到此现象。
昏睡时，病马陷入深睡状态，针刺体表有反应，但极为迟钝，很快又陷入昏睡状态，见于脑炎及颅内压增高等。
昏迷时，病马倒地，昏迷不醒，意识丧失，反射消失，针刺体表毫无反应。常为预后不良的征兆。
2.运动机能检查
健康马的运动自然、协调，息病时，则可引起运动机能改变。
(1)强迫运动：是不受意识支配和外界因素影响的一种不自主运动；常见有盲目运动和圆圈运动，见于脑炎等。
(2)体位平衡失调：病马站立时，表为头部摇晃，体躯歪斜，四肢又开，关节屈曲，力图保持平衡；常见于小脑和前庭器官疾病等。
(3)运动失调：病马运动时，体躯播晃，步样不稳，运动笨拙，四肢高抬，肴地用力，形如涉水；见于大脑、小脑和脊髓疾病等。
(4)痉挛：是括约肌不随意的急剧收缩，又叫抽搐，分为阵发性痉挛和强直性痉挛2种。
阵发性痉挛，是指肌肉一阵阵地不随意收缩，多带有节奏性，见于钙、镁缺乏及某些传染病和中毒等。
强直性痉挛，是指肌肉长时间的连续性收缩，无迟缓和间歇，常见于破伤风、马钱子中毒和有机农药中毒等。
(5)瘫痪(麻痹)：运动机能完全丧失称为瘫痪(完全麻痹)；运动机能不全丧失，称为轻瘫(不全麻痹)。一侧体躯的瘫痪叫偏瘫，是脑部的疾病；后躯的瘫痪叫截瘫，是脊髓的疾病。
3.感觉机能检查
着重检查痛觉和瞳孔对光的反应。
检查痛觉时，应先把马的眼睛遮住，之后用针头以不同的力量针刺皮肤，观察马的反应。一般先从感觉迟钝的臀部开始，然后沿脊柱两侧向前，直至颈侧、头部.对四肢做环行针刺。健康马针刺后立即出现反应，表现相应部位的肌肉收缩，被毛颤动，或迅速回头、竖耳、踢咬等。感觉过敏(轻刺时呈现强烈反应)，见于局部炎症及脊髓膜炎等；感觉减退，见于脊髓损伤等；感觉消失，见于脊髓横贯性损伤及意识丧失等。
检查瞳孔对光的反应时，用手电筒光迅速照射瞳孔，观察瞳孔有无反应。健康马，在强光照射时，瞳孔迅速缩小，除去光照时，随即恢复原态。如果瞳孔扩大，对光反射消失，见于某些脑病等。在马脑炎过程中常可看到眼球呈水平、垂直或回转震颤。
4.反射检查
着重检查耳反射和肛门反射。
检查耳反射，用一根细棍轻触耳内侧被毛，正常时马即播耳转头。检查肛门反射，用细棍轻触或针刺肛门部皮肤，正常时肛门括约肌产生一连串短而急的收缩。反射增强，多由于神经系统兴奋性普遍增高所致；反射减弱或消失，多是神经系统处于抑制状态。