2001年6月25日，昭苏圣佑庙被中华人民共和国国务院公布为第五批全国重点文物保护单位

昭苏圣佑庙作为新疆现存规模最大的黄教寺院，承载着左翼厄鲁特蒙古人的深厚信仰与多元文化记忆，其选址坐北朝南，以严谨对称的布局勾勒出独特的建筑肌理 —— 照壁、山门、前殿、大殿、后殿沿中轴线依次排布，如同一条文化脉络串联起核心空间，两侧的硬山顶配殿与八角形双层双檐阁则形成巧妙呼应，钟鼓楼的八角平面设计更添建筑韵律；其中大殿尤为亮眼，不仅面阔开阔、覆盖庄重的歇山顶，周环的檐廊既拓展了空间层次，又为殿内的彩绘梁枋与精美壁画提供了绝佳展示载体。